يسعى قطاع الصحة العامة والمختبرات المركزية إلى زيادة الوعي الصحي والارتقاء بالصحة العامة في إمارة الشارقة من خلال إعداد وتنسيق وتنفيذ برامج التثقيف الصحي والتوعية البيئية، ويتولى القطاع مهمة الإشراف الصحي على جميع الأغذية التي ترد للدولة أو المنتجة محلياً والموجودة بالأسواق والتأكد من التزام المؤسسات التي تعمل في إنتاج وتداول الأغذية بتطبيق التشريعات والأنظمة والمواصفات والمقاييس المعتمدة، ومن بين اختصاصات القطاع تقديم الخدمات البيطرية والأنشطة ذات الصلة بصحة وفحص الحيوانات واللحوم بالمسالخ ومراقبة أسواق بيع الحيوانات واللحوم، ويختص القطاع كذلك بالرقابة الصحية على المنشآت ذات العلاقة بالصحة العامة كالفنادق والمدارس ودور الحضانة وصالونات الحلاقة والتجميل ومحلات الأغذية الصحية ومستحضرات التجميل والعناية الشخصية.